Dalam rangka menanamkan nilai-nilai keagamaan kepada siswa sehingga selain memiliki ilmu pengetahuan dan keterampilan, juga memiliki budi pekerti yang baik, maka setiap pagi dilaksanakan shalat dhuha dan tahsin Al-Qur’an untuk siswa yang beragama Islam, serta ibadah pagi bagi siswa yang beragama Kristen Protestan dan Katholik dibawah bimbingan guru agama masing-masing 
SMK Muhammadiyah Kupang (SMKMu) gelar Ujian Kompetensi Kejuruan (UKK) untuk siswa kelas XII di ruangan Lab Komputer pada tanggal (17-19/02/2025) dengan menghadirkan penguji (Assesor) eksternal yakni Maksen Mauk, S.Pd.,M.Pd. Pelaksanan
SMK Muhammadiyah Kupang pada Kamis 11/09/2025, gelar pembukaan Pembekalan Praktek Kerja Lapangan (PKL) untuk murid kelas XII yang merupakan amanat Undang-Undang Sisdiknas Nomor 20 Tahun 2003 tentang Sistem Pendidikan Nasional, Peraturan Menteri
SMK Muhammadiyah Kupang gelar Upacara Peringatan Kemerdekaan RI ke-80 di halaman Kampus Universitas Muhammadiyah Kupang, Ahad 17 Agustus 2025 Bertindak sebagai Inspektur Upacara adalah Sekretaris Majelis Pendidikan Dasar Menengah dan